W czerwcu 1996 roku z inicjatywy Ligi Morskiej i Rzecznej opracowano dokument pod nazwą „Memoriał w sprawie wód Polskich” na kanwie którego Liga wystąpiła do jednostek samorządu terytorialnego o wsparcie inicjatywy przywrócenie rzek ich społeczeństwom oraz o jednoczenie się wokół tej idei. Na apel pierwsze odpowiedziały miasta nadwiślańskie tworząc Związek Miast Nadwiślańskich. Również miasta i gminy nadnoteckie upatrując szansę na rozwój w oparciu o rzekę Noteć postanowiły działać wspólnie. W dniu 21 stycznia 2000 roku pięć miast i trzy gminy podpisały akt założycielski Stowarzyszenia pn. Związek Miast i Gmin Nadnoteckich. W celu wyżej przytoczonych postanowień 5 grudnia 2000 roku podpisano porozumienie na lata 2000 – 2020 „Przywrócić Noteć miastom i gminom oraz ich społeczeństwom". Program zobowiązuje sygnatariuszy porozumienia do wspólnej pracy na rzecz poprawy stanu i infrastruktury Noteci.
Podstawowe cele: wspieranie idei samorządu terytorialnego, integracja wspólnot lokalnych, dążenie do gospodarczego, kulturowego i turystycznego rozwoju miast i gmin nadnoteckich, inicjowanie i wspieranie działań, zmierzających do przywrócenia jakości wód Noteci, jej żeglowności, infrastruktury komunikacyjnej, turystycznej, rekreacyjnej i sportowej, utrzymanie walorów przyrodniczych i krajobrazowych Noteci.